Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC129Q6ZRS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms