Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN12Q6JVE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LCN12Q6JVE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN12Q6JVE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN12Q6JVE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN12Q6JVE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms