Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN12Q6JVE5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN12Q6JVE5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN12Q6JVE5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN12Q6JVE5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCN12Q6JVE5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN12Q6JVE5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCN12Q6JVE5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCN12Q6JVE5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCN12Q6JVE5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LCN12Q6JVE5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCN12Q6JVE5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCN12Q6JVE5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN12Q6JVE5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN12Q6JVE5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN12Q6JVE5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCN12Q6JVE5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN12Q6JVE5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN12Q6JVE5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN12Q6JVE5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN12Q6JVE5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN12Q6JVE5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN12Q6JVE5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN12Q6JVE5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN12Q6JVE5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN12Q6JVE5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN12Q6JVE5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN12Q6JVE5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN12Q6JVE5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN12Q6JVE5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN12Q6JVE5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN12Q6JVE5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCN12Q6JVE5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCN12Q6JVE5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCN12Q6JVE5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN12Q6JVE5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCN12Q6JVE5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN12Q6JVE5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN12Q6JVE5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN12Q6JVE5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN12Q6JVE5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN12Q6JVE5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN12Q6JVE5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN12Q6JVE5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCN12Q6JVE5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCN12Q6JVE5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCN12Q6JVE5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN12Q6JVE5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN12Q6JVE5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN12Q6JVE5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN12Q6JVE5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN12Q6JVE5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN12Q6JVE5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN12Q6JVE5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN12Q6JVE5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN12Q6JVE5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN12Q6JVE5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN12Q6JVE5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN12Q6JVE5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN12Q6JVE5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCN12Q6JVE5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCN12Q6JVE5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCN12Q6JVE5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN12Q6JVE5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN12Q6JVE5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN12Q6JVE5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN12Q6JVE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN12Q6JVE5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN12Q6JVE5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN12Q6JVE5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN12Q6JVE5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN12Q6JVE5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN12Q6JVE5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN12Q6JVE5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN12Q6JVE5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN12Q6JVE5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN12Q6JVE5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN12Q6JVE5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN12Q6JVE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN12Q6JVE5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms