Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDK2Q58EX2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms