Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 DDX54-204ENST00000546898 479 ntTSL 315.8■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 DDX54-205ENST00000548786 498 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FARP2-218ENST00000485051 575 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 FARP2-212ENST00000471447 580 ntTSL 45.4□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.523e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 522.42■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 218.1■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 CDC34-202ENST00000586283 1147 ntTSL 317.71■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 CDC34-207ENST00000607527 357 ntTSL 514.14□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 LPIN2-203ENST00000584294 936 ntTSL 317.75■□□□□ 0.439e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.629e-8■■■■■ 31.7
TARDBPQ13148 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 327.76■■■□□ 2.032e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 227.26■■□□□ 1.952e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 426.03■■□□□ 1.762e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 526.03■■□□□ 1.762e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 49.97□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.115e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 PDE4A-208ENST00000591971 836 ntTSL 512.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.737e-9■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.927e-9■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.067e-9■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.895e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.279e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-203ENST00000412341 1916 ntTSL 521.21■□□□□ 0.999e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-208ENST00000470787 1544 ntTSL 221.07■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-211ENST00000477070 1521 ntTSL 519.93■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-227ENST00000533927 2026 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 ZNF692-206ENST00000463519 2704 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 31.6
TARDBPQ13148 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 AC079062.1-204ENST00000583405 474 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 CDC14A-204ENST00000455467 841 ntTSL 36.57□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NHLRC3-205ENST00000485407 623 ntTSL 35.98□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.267e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 321.85■■□□□ 1.097e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.867e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.857e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.827e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.04□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 PICALM-216ENST00000531771 631 ntTSL 36.2□□□□□ -1.427e-10■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 STRBP-207ENST00000479114 832 ntTSL 36.17□□□□□ -1.422e-9■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 MACF1-211ENST00000467673 792 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 516.99■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 31.5
TARDBPQ13148 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 ADGRL1-205ENST00000590223 424 ntTSL 313.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.527e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 54.17□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 220.88■□□□□ 0.939e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 519.41■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 518.59■□□□□ 0.579e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 218.59■□□□□ 0.579e-8■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 312.92□□□□□ -0.349e-8■■■■■ 31.4
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