Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F3Q08477 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F3Q08477 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms