Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPI1P60174 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPI1P60174 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPI1P60174 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPI1P60174 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPI1P60174 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPI1P60174 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPI1P60174 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPI1P60174 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms