Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD12P35452 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms