Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BMI1P35226 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BMI1P35226 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BMI1P35226 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BMI1P35226 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BMI1P35226 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMI1P35226 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMI1P35226 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMI1P35226 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMI1P35226 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMI1P35226 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms