Protein–RNA interactions for Protein: B1AHC4

PRR5-ARHGAP8, PRR5-ARHGAP8 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms