Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF24Q9UPV7 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms