Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASPRV1Q53RT3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASPRV1Q53RT3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms