Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms