Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMF1P82094 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMF1P82094 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms