Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMP3P12645 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms