Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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