Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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