Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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UBE2V1Q13404 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UBE2V1Q13404 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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