Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-216ENST00000460756 3524 ntTSL 512.08□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 TUBGCP6-206ENST00000489511 612 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 211.2□□□□□ -0.621e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-219ENST00000476924 820 ntTSL 211.04□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-227ENST00000534203 576 ntTSL 39.84□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-222ENST00000490857 1653 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -11e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 PHF14-205ENST00000473050 695 ntTSL 27.76□□□□□ -1.171e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 27.5□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 DNAJC16-205ENST00000475133 6299 ntTSL 1 (best)7.17□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-215ENST00000456345 729 ntTSL 26.7□□□□□ -1.341e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 PHF14-204ENST00000470665 1005 ntTSL 24.72□□□□□ -1.651e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-212ENST00000436791 726 ntTSL 44.51□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 PHF14-211ENST00000493922 408 ntTSL 32.88□□□□□ -1.951e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 PHF14-203ENST00000469407 1991 ntTSL 21.91□□□□□ -2.11e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-209ENST00000397174 2977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-204ENST00000361705 3115 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-217ENST00000498793 583 ntTSL 310.56□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.873e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-211ENST00000456518 1586 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-212ENST00000460215 447 ntTSL 37.75□□□□□ -1.173e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 SCMH1-216ENST00000489421 687 ntTSL 36.92□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt18.46■□□□□ 0.552e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.122e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 512.89□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 211.54□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-209ENST00000597705 892 ntTSL 311.17□□□□□ -0.622e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-204ENST00000595794 941 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-206ENST00000596554 727 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 C19orf48-211ENST00000599004 866 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 AFDN-214ENST00000486649 423 ntTSL 29.23□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 AFDN-220ENST00000511503 1257 ntTSL 27.58□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 AFDN-222ENST00000515794 746 ntTSL 37.58□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 AFDN-213ENST00000485634 606 ntTSL 27.41□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.136e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.716e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 518.94■□□□□ 0.626e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.536e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 211.34□□□□□ -0.596e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.28e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.288e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 CFI-203ENST00000504853 2368 ntTSL 26.61□□□□□ -1.358e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.588e-14■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.58e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.088e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.018e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -08e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 214.85□□□□□ -0.038e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 213.28□□□□□ -0.288e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 511.24□□□□□ -0.618e-7■□□□□ 9.5
SF3A3Q12874 GTF3C2-204ENST00000423998 828 ntTSL 512.53□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GTF3C2-208ENST00000457748 557 ntTSL 511.82□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 211.98□□□□□ -0.499e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 DDRGK1-204ENST00000496781 865 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.949e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 HNRNPL-205ENST00000595804 588 ntTSL 28.98□□□□□ -0.979e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.989e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 IST1-209ENST00000536027 823 ntTSL 33.91□□□□□ -1.781e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.794e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 519.51■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 516.39■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 511.15□□□□□ -0.625e-7■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 225.25■■□□□ 1.637e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 221.34■■□□□ 1.017e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.867e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.157e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 315.28■□□□□ 0.047e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-206ENST00000564557 582 ntTSL 312.24□□□□□ -0.457e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 212.14□□□□□ -0.477e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 311.89□□□□□ -0.517e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-215ENST00000569020 535 ntTSL 411.58□□□□□ -0.567e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 311.58□□□□□ -0.567e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.587e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 211.25□□□□□ -0.617e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 311.01□□□□□ -0.657e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 GNAS-205ENST00000338783 641 ntTSL 310.36□□□□□ -0.757e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 CNOT1-208ENST00000565697 385 ntTSL 38.76□□□□□ -1.017e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 FNDC3B-210ENST00000483344 666 ntTSL 35.03□□□□□ -1.67e-9■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ZNF638-217ENST00000483421 2076 ntTSL 24.87□□□□□ -1.637e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ZNF638-225ENST00000494241 703 ntTSL 34.66□□□□□ -1.667e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 ZNF638-202ENST00000409407 4470 ntTSL 21.89□□□□□ -2.117e-13■□□□□ 9.4
SF3A3Q12874 SNHG21-202ENST00000558174 725 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-12■□□□□ 9.4
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