Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNQ1P51787 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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KCNQ1P51787 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1P51787 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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