RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.34■■■□□ 2.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC9O60706 1549 aa30.07■■■□□ 2.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.61■■■□□ 2.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NACADO15069 1562 aa28.38■■■□□ 2.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.08■■■□□ 2.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.99■■■□□ 2.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.95■■■□□ 2.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.78■■■□□ 2.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.56■■■□□ 2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.42■■□□□ 1.98
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCRIBQ14160 1630 aa27.33■■□□□ 1.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.19■■□□□ 1.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.11■■□□□ 1.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.08■■□□□ 1.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCA4P51532 1647 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.04■■□□□ 1.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCA2P51531 1590 aa26.02■■□□□ 1.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGXB3Q12766 1538 aa26.02■■□□□ 1.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUX2O14529 1486 aa26■■□□□ 1.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERCC6Q03468 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.81■■□□□ 1.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NESP48681 1621 aa25.8■■□□□ 1.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.78■■□□□ 1.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.68■■□□□ 1.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.64■■□□□ 1.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.52■■□□□ 1.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.45■■□□□ 1.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WIZO95785 1651 aa25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.27■■□□□ 1.64
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR62O43379 1518 aa25.24■■□□□ 1.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.14■■□□□ 1.62
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFTRP13569 1480 aa25.07■■□□□ 1.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM2Q13029 1718 aa24.88■■□□□ 1.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM41Q8WV44 630 aa24.85■■□□□ 1.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.74■■□□□ 1.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSCARQ8IYS5 282 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT140Q96RY7 1462 aa24.64■■□□□ 1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOPBP1Q92547 1522 aa24.61■■□□□ 1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC8Q09428 1581 aa24.54■■□□□ 1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.53■■□□□ 1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.49■■□□□ 1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF11O15085 1522 aa24.39■■□□□ 1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHD1O14646 1710 aa24.36■■□□□ 1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.25■■□□□ 1.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOGA1O94964 1423 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR97A6NE52 1622 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBLN2P98095 1184 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARAP1Q96P48 1450 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUX1P39880 1505 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN2BQ13224 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNJ1O43426 1573 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBRM1Q86U86 1689 aa23.99■■□□□ 1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNJ2O15056 1496 aa23.98■■□□□ 1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.93■■□□□ 1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.91■■□□□ 1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.91■■□□□ 1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.77■■□□□ 1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS12P58397 1594 aa23.75■■□□□ 1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN2AQ12879 1464 aa23.74■■□□□ 1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOP2BQ02880 1626 aa23.74■■□□□ 1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP170Q5SW79 1584 aa23.67■■□□□ 1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP160Q12769 1436 aa23.67■■□□□ 1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.65■■□□□ 1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.62■■□□□ 1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.61■■□□□ 1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHROOM2Q13796 1616 aa23.6■■□□□ 1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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