Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIFKQ9BYG3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms