Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EFHD1Q9BUP0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EFHD1Q9BUP0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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