Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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STRN3Q13033 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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