Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms