Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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