Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSC2P49815 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC2P49815 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC2P49815 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms