Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms