Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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