Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCATO75600 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GCATO75600 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms