Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNPO2L-201ENST00000372873 4121 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms