RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272342.5

ETAA1-201, Transcript of ETAA1, ATR kinase activator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ETAA1, Length 3,418 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETAA1-201ENST00000272342 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.96■■■□□ 2.07
ETAA1-201ENST00000272342 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.96■■□□□ 1.43
ETAA1-201ENST00000272342 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.75■■□□□ 1.39
ETAA1-201ENST00000272342 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ETAA1-201ENST00000272342 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.55■■□□□ 1.36
ETAA1-201ENST00000272342 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ETAA1-201ENST00000272342 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.82■■□□□ 1.24
ETAA1-201ENST00000272342 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.54■■□□□ 1.2
ETAA1-201ENST00000272342 SCRIBQ14160 1630 aa22.42■■□□□ 1.18
ETAA1-201ENST00000272342 ABCC9O60706 1549 aa22.41■■□□□ 1.18
ETAA1-201ENST00000272342 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.4■■□□□ 1.18
ETAA1-201ENST00000272342 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ETAA1-201ENST00000272342 NACADO15069 1562 aa22.05■■□□□ 1.12
ETAA1-201ENST00000272342 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.96■■□□□ 1.11
ETAA1-201ENST00000272342 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.91■■□□□ 1.1
ETAA1-201ENST00000272342 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.86■■□□□ 1.09
ETAA1-201ENST00000272342 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.78■■□□□ 1.08
ETAA1-201ENST00000272342 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.75■■□□□ 1.07
ETAA1-201ENST00000272342 TRIM41Q8WV44 630 aa21.74■■□□□ 1.07
ETAA1-201ENST00000272342 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ETAA1-201ENST00000272342 WIZO95785 1651 aa21.65■■□□□ 1.06
ETAA1-201ENST00000272342 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.61■■□□□ 1.05
ETAA1-201ENST00000272342 HRCP23327 699 aa21.51■■□□□ 1.03
ETAA1-201ENST00000272342 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ETAA1-201ENST00000272342 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ETAA1-201ENST00000272342 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.4■■□□□ 1.02
ETAA1-201ENST00000272342 SMARCA4P51532 1647 aa21.33■■□□□ 1
ETAA1-201ENST00000272342 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ETAA1-201ENST00000272342 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
ETAA1-201ENST00000272342 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
ETAA1-201ENST00000272342 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.22■□□□□ 0.99
ETAA1-201ENST00000272342 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.18■□□□□ 0.98
ETAA1-201ENST00000272342 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ETAA1-201ENST00000272342 ABCC8Q09428 1581 aa21.16■□□□□ 0.98
ETAA1-201ENST00000272342 SMARCA2P51531 1590 aa21.15■□□□□ 0.98
ETAA1-201ENST00000272342 SOGA1O94964 1423 aa20.93■□□□□ 0.94
ETAA1-201ENST00000272342 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.86■□□□□ 0.93
ETAA1-201ENST00000272342 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
ETAA1-201ENST00000272342 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.84■□□□□ 0.93
ETAA1-201ENST00000272342 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.83■□□□□ 0.93
ETAA1-201ENST00000272342 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ETAA1-201ENST00000272342 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
ETAA1-201ENST00000272342 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ETAA1-201ENST00000272342 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.78■□□□□ 0.92
ETAA1-201ENST00000272342 CEP162Q5TB80 1403 aa20.72■□□□□ 0.91
ETAA1-201ENST00000272342 SYNJ1O43426 1573 aa20.67■□□□□ 0.9
ETAA1-201ENST00000272342 EEA1Q15075 1411 aa20.65■□□□□ 0.9
ETAA1-201ENST00000272342 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ETAA1-201ENST00000272342 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.64■□□□□ 0.9
ETAA1-201ENST00000272342 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ETAA1-201ENST00000272342 GOLGA3Q08378 1498 aa20.58■□□□□ 0.88
ETAA1-201ENST00000272342 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ETAA1-201ENST00000272342 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ETAA1-201ENST00000272342 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.47■□□□□ 0.87
ETAA1-201ENST00000272342 NCAPD3P42695 1498 aa20.44■□□□□ 0.86
ETAA1-201ENST00000272342 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.4■□□□□ 0.86
ETAA1-201ENST00000272342 HMGXB3Q12766 1538 aa20.39■□□□□ 0.85
ETAA1-201ENST00000272342 CLIP1P30622 1438 aa20.38■□□□□ 0.85
ETAA1-201ENST00000272342 KIF21BO75037 1637 aa20.37■□□□□ 0.85
ETAA1-201ENST00000272342 TOP2BQ02880 1626 aa20.37■□□□□ 0.85
ETAA1-201ENST00000272342 CUX1P39880 1505 aa20.27■□□□□ 0.84
ETAA1-201ENST00000272342 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.26■□□□□ 0.83
ETAA1-201ENST00000272342 APLP2Q06481 763 aa20.25■□□□□ 0.83
ETAA1-201ENST00000272342 CFTRP13569 1480 aa20.24■□□□□ 0.83
ETAA1-201ENST00000272342 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ETAA1-201ENST00000272342 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.22■□□□□ 0.83
ETAA1-201ENST00000272342 KIF27Q86VH2 1401 aa20.15■□□□□ 0.82
ETAA1-201ENST00000272342 PRXQ9BXM0 1461 aa20.15■□□□□ 0.82
ETAA1-201ENST00000272342 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.1■□□□□ 0.81
ETAA1-201ENST00000272342 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.08■□□□□ 0.8
ETAA1-201ENST00000272342 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.08■□□□□ 0.8
ETAA1-201ENST00000272342 CUX2O14529 1486 aa20.05■□□□□ 0.8
ETAA1-201ENST00000272342 ARAP1Q96P48 1450 aa20.03■□□□□ 0.8
ETAA1-201ENST00000272342 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ETAA1-201ENST00000272342 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.97■□□□□ 0.79
ETAA1-201ENST00000272342 IGF1RP08069 1367 aa19.96■□□□□ 0.79
ETAA1-201ENST00000272342 PRDM2Q13029 1718 aa19.94■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.92■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 NESP48681 1621 aa19.9■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.9■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.89■□□□□ 0.78
ETAA1-201ENST00000272342 P3H3Q8IVL6 736 aa19.85■□□□□ 0.77
ETAA1-201ENST00000272342 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.84■□□□□ 0.77
ETAA1-201ENST00000272342 ITGAEP38570 1179 aa19.83■□□□□ 0.77
ETAA1-201ENST00000272342 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
ETAA1-201ENST00000272342 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.8■□□□□ 0.76
ETAA1-201ENST00000272342 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
ETAA1-201ENST00000272342 TOPBP1Q92547 1522 aa19.75■□□□□ 0.75
ETAA1-201ENST00000272342 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ETAA1-201ENST00000272342 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.73■□□□□ 0.75
ETAA1-201ENST00000272342 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ETAA1-201ENST00000272342 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.69■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.66■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.64■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
ETAA1-201ENST00000272342 NEUROD1Q13562 356 aa19.64■□□□□ 0.73
ETAA1-201ENST00000272342 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms