Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRX1P78414 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IRX1P78414 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IRX1P78414 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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