Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms