Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOXF2Q9BQY4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms