Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms