Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC01547P58512 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms