Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD2Q9UGT4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD2Q9UGT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms