Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 519.57■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 MTCL1-209ENST00000520495 3286 ntTSL 216.69■□□□□ 0.265e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 513.43□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 45.74□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC12.41□□□□□ -0.421e-9■■■■□ 22
SLTMQ9NWH9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 319.58■□□□□ 0.724e-8■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.264e-8■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PURA-203ENST00000505703 597 ntTSL 327.83■■■□□ 2.055e-8■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.927e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 231.67■■■□□ 2.667e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 231.26■■■□□ 2.597e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.317e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.037e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 326.51■■□□□ 1.837e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.837e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 INPPL1-209ENST00000540973 375 ntTSL 325.58■■□□□ 1.697e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.668e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.34■■□□□ 1.657e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.637e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-211ENST00000639478 7992 ntTSL 525.22■■□□□ 1.637e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.627e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MACROD1-203ENST00000538595 868 ntTSL 325.11■■□□□ 1.613e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 324.78■■□□□ 1.564e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.547e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TNK2-210ENST00000433111 580 ntTSL 424.24■■□□□ 1.477e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 424.09■■□□□ 1.458e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 224.08■■□□□ 1.447e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 523.49■■□□□ 1.354e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-212ENST00000640028 7375 ntTSL 523.47■■□□□ 1.357e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 223.07■■□□□ 1.284e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 INPPL1-214ENST00000543234 275 ntTSL 222.73■■□□□ 1.237e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-203ENST00000553512 636 ntTSL 522.62■■□□□ 1.217e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.198e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MIDN-203ENST00000586843 416 ntTSL 222■■□□□ 1.117e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.077e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.077e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.057e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.047e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 221.51■■□□□ 1.038e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.037e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 521.07■□□□□ 0.968e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.968e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 520.95■□□□□ 0.947e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 KRTAP5-AS1-202ENST00000524947 570 ntTSL 420.58■□□□□ 0.897e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.868e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.867e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.847e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.818e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.87e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 419.98■□□□□ 0.797e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.787e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PKD1P5-206ENST00000545970 490 ntTSL 319.76■□□□□ 0.757e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 219.7■□□□□ 0.747e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 319.43■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.697e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 KRTAP5-AS1-204ENST00000534077 409 ntTSL 319.24■□□□□ 0.677e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.677e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 519.15■□□□□ 0.667e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PNPLA2-202ENST00000525250 2726 ntTSL 219.1■□□□□ 0.657e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.647e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 218.78■□□□□ 0.67e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.587e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 518.4■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 VAC14-210ENST00000568548 2945 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 RPH3AL-207ENST00000572075 569 ntTSL 418.02■□□□□ 0.487e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 518.01■□□□□ 0.477e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SRC-206ENST00000472968 461 ntTSL 317.97■□□□□ 0.477e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.467e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 517.65■□□□□ 0.428e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 417.65■□□□□ 0.428e-11■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 517.57■□□□□ 0.47e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-211ENST00000507123 554 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.397e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 ZFYVE21-205ENST00000554255 570 ntTSL 217.46■□□□□ 0.397e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 217.39■□□□□ 0.387e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 317.29■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 PKD1P5-203ENST00000542593 761 ntTSL 517.21■□□□□ 0.357e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-209ENST00000504822 259 ntTSL 417.17■□□□□ 0.347e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 217.1■□□□□ 0.337e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 316.96■□□□□ 0.317e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 516.5■□□□□ 0.237e-6■■■■□ 21.9
SLTMQ9NWH9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.27e-6■■■■□ 21.9
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