RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538595.1

MACROD1-203, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 868 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-203ENST00000538595 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.09■■■■■ 7.37
MACROD1-203ENST00000538595 ABCC9O60706 1549 aa54.85■■■■■ 6.37
MACROD1-203ENST00000538595 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.7■■■■■ 6.35
MACROD1-203ENST00000538595 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.11■■■■■ 5.93
MACROD1-203ENST00000538595 NACADO15069 1562 aa51.76■■■■■ 5.88
MACROD1-203ENST00000538595 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.63■■■■■ 5.86
MACROD1-203ENST00000538595 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.56■■■■■ 5.84
MACROD1-203ENST00000538595 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.14■■■■■ 5.78
MACROD1-203ENST00000538595 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.04■■■■■ 5.76
MACROD1-203ENST00000538595 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.92■■■■■ 5.74
MACROD1-203ENST00000538595 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.67■■■■■ 5.7
MACROD1-203ENST00000538595 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.63■■■■■ 5.7
MACROD1-203ENST00000538595 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.41■■■■■ 5.66
MACROD1-203ENST00000538595 SCRIBQ14160 1630 aa49.95■■■■■ 5.59
MACROD1-203ENST00000538595 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.88■■■■■ 5.57
MACROD1-203ENST00000538595 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.5■■■■■ 5.51
MACROD1-203ENST00000538595 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.4■■■■■ 5.5
MACROD1-203ENST00000538595 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.38■■■■■ 5.5
MACROD1-203ENST00000538595 NCAPD3P42695 1498 aa47.84■■■■■ 5.25
MACROD1-203ENST00000538595 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.72■■■■■ 5.23
MACROD1-203ENST00000538595 SMARCA4P51532 1647 aa47.62■■■■■ 5.21
MACROD1-203ENST00000538595 SMARCA2P51531 1590 aa47.5■■■■■ 5.19
MACROD1-203ENST00000538595 HMGXB3Q12766 1538 aa47.43■■■■■ 5.18
MACROD1-203ENST00000538595 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
MACROD1-203ENST00000538595 ERCC6Q03468 1493 aa47.3■■■■■ 5.16
MACROD1-203ENST00000538595 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.25■■■■■ 5.15
MACROD1-203ENST00000538595 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
MACROD1-203ENST00000538595 CUX2O14529 1486 aa47.19■■■■■ 5.14
MACROD1-203ENST00000538595 NESP48681 1621 aa47.15■■■■■ 5.14
MACROD1-203ENST00000538595 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.15■■■■■ 5.14
MACROD1-203ENST00000538595 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.11■■■■■ 5.13
MACROD1-203ENST00000538595 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.69■■■■■ 5.07
MACROD1-203ENST00000538595 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
MACROD1-203ENST00000538595 WIZO95785 1651 aa46.5■■■■■ 5.03
MACROD1-203ENST00000538595 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.46■■■■■ 5.03
MACROD1-203ENST00000538595 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.43■■■■■ 5.02
MACROD1-203ENST00000538595 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.41■■■■■ 5.02
MACROD1-203ENST00000538595 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
MACROD1-203ENST00000538595 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.08■■■■■ 4.97
MACROD1-203ENST00000538595 WDR62O43379 1518 aa45.96■■■■■ 4.95
MACROD1-203ENST00000538595 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
MACROD1-203ENST00000538595 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.88■■■■■ 4.94
MACROD1-203ENST00000538595 CFTRP13569 1480 aa45.87■■■■■ 4.93
MACROD1-203ENST00000538595 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.87■■■■■ 4.93
MACROD1-203ENST00000538595 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
MACROD1-203ENST00000538595 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.44■■■■■ 4.87
MACROD1-203ENST00000538595 PRDM2Q13029 1718 aa45.26■■■■■ 4.84
MACROD1-203ENST00000538595 TRIM41Q8WV44 630 aa45.2■■■■■ 4.83
MACROD1-203ENST00000538595 OSCARQ8IYS5 282 aa45.1■■■■■ 4.81
MACROD1-203ENST00000538595 TOPBP1Q92547 1522 aa45■■■■■ 4.79
MACROD1-203ENST00000538595 IFT140Q96RY7 1462 aa44.98■■■■■ 4.79
MACROD1-203ENST00000538595 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
MACROD1-203ENST00000538595 ABCC8Q09428 1581 aa44.83■■■■■ 4.77
MACROD1-203ENST00000538595 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.8■■■■■ 4.76
MACROD1-203ENST00000538595 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
MACROD1-203ENST00000538595 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
MACROD1-203ENST00000538595 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.58■■■■■ 4.73
MACROD1-203ENST00000538595 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
MACROD1-203ENST00000538595 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.47■■■■■ 4.71
MACROD1-203ENST00000538595 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.47■■■■■ 4.71
MACROD1-203ENST00000538595 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.47■■■■■ 4.71
MACROD1-203ENST00000538595 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.43■■■■■ 4.7
MACROD1-203ENST00000538595 ARHGEF11O15085 1522 aa44.35■■■■■ 4.69
MACROD1-203ENST00000538595 SOGA1O94964 1423 aa44.35■■■■■ 4.69
MACROD1-203ENST00000538595 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
MACROD1-203ENST00000538595 CHD1O14646 1710 aa44.28■■■■■ 4.68
MACROD1-203ENST00000538595 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.27■■■■■ 4.68
MACROD1-203ENST00000538595 FBLN2P98095 1184 aa44.27■■■■■ 4.68
MACROD1-203ENST00000538595 CUX1P39880 1505 aa44.25■■■■■ 4.67
MACROD1-203ENST00000538595 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
MACROD1-203ENST00000538595 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.09■■■■■ 4.65
MACROD1-203ENST00000538595 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.08■■■■■ 4.65
MACROD1-203ENST00000538595 WDR97A6NE52 1622 aa44.03■■■■■ 4.64
MACROD1-203ENST00000538595 ARAP1Q96P48 1450 aa43.96■■■■■ 4.63
MACROD1-203ENST00000538595 GRIN2BQ13224 1484 aa43.94■■■■■ 4.62
MACROD1-203ENST00000538595 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
MACROD1-203ENST00000538595 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
MACROD1-203ENST00000538595 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
MACROD1-203ENST00000538595 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.8■■■■■ 4.6
MACROD1-203ENST00000538595 SYNJ2O15056 1496 aa43.79■■■■■ 4.6
MACROD1-203ENST00000538595 SYNJ1O43426 1573 aa43.75■■■■■ 4.59
MACROD1-203ENST00000538595 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.75■■■■■ 4.59
MACROD1-203ENST00000538595 PBRM1Q86U86 1689 aa43.7■■■■■ 4.59
MACROD1-203ENST00000538595 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.66■■■■■ 4.58
MACROD1-203ENST00000538595 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.573e-7■■■■□ 25.1
MACROD1-203ENST00000538595 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
MACROD1-203ENST00000538595 TOP2BQ02880 1626 aa43.48■■■■■ 4.55
MACROD1-203ENST00000538595 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.46■■■■■ 4.55
MACROD1-203ENST00000538595 GRIN2AQ12879 1464 aa43.38■■■■■ 4.54
MACROD1-203ENST00000538595 ADAMTS12P58397 1594 aa43.34■■■■■ 4.53
MACROD1-203ENST00000538595 NUP160Q12769 1436 aa43.25■■■■■ 4.51
MACROD1-203ENST00000538595 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.24■■■■■ 4.51
MACROD1-203ENST00000538595 CEP170Q5SW79 1584 aa43.24■■■■■ 4.51
MACROD1-203ENST00000538595 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.21■■■■■ 4.51
MACROD1-203ENST00000538595 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.17■■■■■ 4.5
MACROD1-203ENST00000538595 SHROOM2Q13796 1616 aa43■■■■■ 4.47
MACROD1-203ENST00000538595 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
MACROD1-203ENST00000538595 JPH4Q96JJ6 628 aa42.84■■■■■ 4.45
MACROD1-203ENST00000538595 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.72■■■■■ 4.43
MACROD1-203ENST00000538595 IGF1RP08069 1367 aa42.72■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms