Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms