Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP7Q93009 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP7Q93009 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP7Q93009 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP7Q93009 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP7Q93009 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP7Q93009 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP7Q93009 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP7Q93009 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP7Q93009 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP7Q93009 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP7Q93009 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP7Q93009 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms