Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP27Q8WVK2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP27Q8WVK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP27Q8WVK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms