Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHERPQ8IWX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHERPQ8IWX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHERPQ8IWX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms