Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD4Q6W3E5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD4Q6W3E5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms