Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTR9Q6PD62 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTR9Q6PD62 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTR9Q6PD62 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms