Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDCA2Q69YH5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA2Q69YH5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms