Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WSCD1Q658N2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WSCD1Q658N2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms