Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPE65Q16518 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPE65Q16518 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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