Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1DQ13901 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1DQ13901 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C1DQ13901 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1DQ13901 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1DQ13901 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1DQ13901 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1DQ13901 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C1DQ13901 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1DQ13901 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1DQ13901 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1DQ13901 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1DQ13901 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1DQ13901 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1DQ13901 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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